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要取消苹果购买的App自动扣款并进行二次验证，可以按照以下步骤操作。
1、打开手机的“设置”应用。
2、导航到顶部，点击顶部的Apple ID，这里会显示已登录的Apple ID信息。
3、点击“iTunes Store和App Store”选项。
4、在顶部，点击Apple ID，并在弹出的对话框中选择“查看Apple ID”，可能需要输入Apple ID的密码或使用Face ID或Touch ID进行验证。
5、在账户设置中，找到并点击“订阅”选项，这里会显示所有订阅中的服务以及自动续订的App。
6、找到需要取消自动扣款的App或服务，点击它，然后点击“取消订阅”或使用开关按钮来关闭自动续订。
7、完成上述操作后，会收到一个确认取消的提示。
关于二次验证，苹果为了安全考虑，可能会要求在进行某些更改时进行额外的身份验证，这通常意味着输入Apple ID密码或使用设备上的安全功能如Face ID或Touch ID，取消自动扣款操作时，按照上述路径进入，如果在过程中遇到需要二次验证的提示，按照相应的提示完成验证即可。
操作可能会因系统更新而略有变化，如果遇到问题，可以参考苹果官方支持或联系苹果客服获取帮助。